Новости химической науки > ДНК как платформа для химических реакций

Методика расшифровки первичной последовательности помогает в обнаружении новых реакций на платформе ДНК.

В 2004 Дэвид Лю (David R. Liu) с соавторами из Гарварда разработали систему, использующую ДНК для обнаружения новых биохимических процессов. К сожалению, возможность применения такой системы ограничивалась условиями, необходимыми для реализации комплементарного спаривания нитей дезоксирибонуклеиовой кислотой.

В новом исследовании, результаты которого недавно опубликованы в JACS, они сообщают о создании платформы второго поколения, не требующей комплементарного спаривания азотистых оснований противолежащих нитей, работающей в органических растворителях и при высоких температурах.

Рисунок: J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/ja074155j

В новой системе используется «реконструированная» архитектура, в которой последовательность единичной нити ДНК служит как «считывающий код» для двух реагентов, A и B (показаны на схеме). Эта система является первой платформой на основе ДНК, кодирующей распознавание каждого реагента на отдельной нити.

С кодирующими нитями ковалентными связями связываются сотни реагентов, но, в каждом конкретном случае, один из реагентов связан с биотином посредством сульфидного линкера. Система позволяет исследователям эффективно различать разнообразные пары реагентов, образующие ковалентную связь (отмечено красным на схеме) и те, которые в заданных условиях не образуют этой связи.

Исследователи продемонстрировали первую из, как они надеются, многочисленного набора реакций, осуществляемых на новой платформе, реакцию – реакцию сочетания индолов и алкенов в мягких условиях.

Источник: J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/ja074155j

метки статьи: #биохимия, #кинетика и катализ, #молекулярная биология, #нанотехнологии