рисовалки формул для биологической активности

[maks]

коллеги, когда то лет 10 назад ,были обсуждения, что есть какие то довольно отстойные программы дающие предикцию биологической активности по структуре типа 0.93 , что будет хороша при допаминергической активности, а 0.76 , что еще на чем то
но иногда они давали очень неплохую кореляцию с проверенными Ki
названия я подзабыл,первая просьба напомнить что за проги
ну и может за это время появились более продвинутые бесплатные

[Nickolas]

Помню on-line программу - PASS.

[JAG]

комитет по борьбе с лженаукой перевёл Вашу тему в курилку

[Vanya Ivanov]

коллеги, когда то лет 10 назад ,были обсуждения, что есть какие то довольно отстойные программы дающие предикцию биологической активности по структуре ....

Если я правильно понял вопрос ... то лучше бы его перенести в рубрику по медхимии биол-хим-молбиол

Основу таких предсказаний составлял некий "ПРОЦЕСС" (программа, набор алгоритмов и тп.): ваша структура преобразовывалась в некоторые дескрипторы и на их основе шел поиск в подготовленных базах данных биологических активностей.
Ничего нового за 10 (с 2009 г) лет не появилось. Те же группы и те же подходы .. однако:

Люди работают.
Произошло существенное расширение ПРОЦЕССа и уточнение основ (базы данных активностей, новые, более надежные дескрипторы и тп.), т.е. повышение предсказательной способности и полезности таких "рисовалок".
Для того что бы правильно пользоваться этим инструментарием нужно, естественно, понимать основы хеминформатики и SAR. что бы данные от этой большой работы не были "отстойными".

CHC-2014-3-483-499.pdf

Я время от времени пользуюсь рядом "рисовалок", они в определенном смысле дополняют друг друга, что бы избежать конкуренции и самоуничтожения:

SwissTargetPrediction
http://www.swisstargetprediction.ch/

SUPER-PRED
http://prediction.charite.de/index.php? ... rch_target

DRAR-CPI
http://cpi.bio-x.cn/drar/

PASS-ONLINE
http://www.pharmaexpert.ru/passonline/

MOLINSPIRATION
https://molinspiration.com/

[maks]

комитет по борьбе с лженаукой перевёл Вашу тему в курилку

это я сюда поставил, в курилку то все заходят

[maks]

уважаемые коллеги Nickolas и Vanya Ivanov спасибо за отклики и объяснения, если стоит перевести в рубрику по медхимии биол-хим-молбиол или там в органику, уважаемым модераторам карты в руки