Orca под докером

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
alien308
Сообщения: 553
Зарегистрирован: Пт окт 23, 2009 8:53 pm

Orca под докером

Сообщение alien308 » Пн окт 21, 2024 8:24 pm

Есть ли опыт работы orca под докером? Требует определённые версии библиотек параллелизации, а калечить систему не хочется. Или подскажите какие ещё способы установки библиотек, чтоб без конфликтов было.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3851
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Orca под докером

Сообщение Ahha » Пн окт 21, 2024 10:22 pm

alien308 писал(а):
Пн окт 21, 2024 8:24 pm
Или подскажите какие ещё способы установки библиотек, чтоб без конфликтов было.
Скачать статически слинкованную версию? На 5.х.х такое было. Шестую пока еще не видел.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

endlesslake
Сообщения: 204
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Orca под докером

Сообщение endlesslake » Вт окт 22, 2024 8:00 pm

что то я не припоминаю у орки версий содержащих MPI библиотеки.

под линуксом это делается просто: OpenMPI конфигурируется c --prefix=/any/folder
в стартовый скрипт орки добавляется перед запуском орки
export LD_LIBRARY_PATH=/any/folder/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=/any/folder/bin:$PATH

на систему никак не влияет

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3851
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Orca под докером

Сообщение Ahha » Вт окт 22, 2024 11:04 pm

endlesslake писал(а):
Вт окт 22, 2024 8:00 pm
что то я не припоминаю у орки версий содержащих MPI библиотеки.

под линуксом это делается просто
Да, действительно, я обсдался. Видимо, перепутал с виндовой версией, она уже идет "всё включено". Но честно не помню, чтобы на серверной убунте пятая орка требовала чего-то такого, чего там уже не было или не ставилось в одно касание без конфликтов с другими библиотеками.

В слакваре - да, похоже я доустанавливал нужную версию OpenMPI, только из головы вылетело: это было черти сколько лет назад. :D
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

endlesslake
Сообщения: 204
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Orca под докером

Сообщение endlesslake » Чт окт 24, 2024 8:13 pm

там еще одно время баг был, из-за которого нужна была версия сконфигурированная с --disable-builtin-atomics
баг вроде рассосался, а привычка делать отдельную версию для орки осталась

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Андрей_Иванович и 2 гостя