Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Уважаемые форумчане, добрый вечер.
При TDDFT (def-2TZVP) в gamess выскочила ошибка связанная с псевдопотенциалом:
*** ERROR ***
AN UNEXPECTED $END WAS ENCOUNTERED IN $ECP GROUP.
EVERY ATOM IN THE MOLECULE MUST BE DEFINED IN $ECP.
Проверил, вроде, в синтаксе все правильно. Помогите разобраться в чем дело.
При TDDFT (def-2TZVP) в gamess выскочила ошибка связанная с псевдопотенциалом:
*** ERROR ***
AN UNEXPECTED $END WAS ENCOUNTERED IN $ECP GROUP.
EVERY ATOM IN THE MOLECULE MUST BE DEFINED IN $ECP.
Проверил, вроде, в синтаксе все правильно. Помогите разобраться в чем дело.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Не уверен, но вроде во входном файле блок DATA должен быть примерно такого вида для каждого атома:
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Если Вы про лишний Enter между симметрией и координатами, то он не лишний.
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
У вас стоит ECP=READ но при этом нет блока $ECP - типа как в http://www.ccl.net/chemistry/resources/ ... 1.008-dir/
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Блок ЕСР прописан в inp
$ECP
C NONE
O NONE
...
H NONE
I-ECP GEN 28 3
4 ----- f-ul potential -----
-21.84204000 2 19.45860900
-28.46819100 2 19.34926000
...
0.24371300 2 4.82376700
0.32080400 2 4.88431500
H NONE
...
H NONE
$END
$ECP
C NONE
O NONE
...
H NONE
I-ECP GEN 28 3
4 ----- f-ul potential -----
-21.84204000 2 19.45860900
-28.46819100 2 19.34926000
...
0.24371300 2 4.82376700
0.32080400 2 4.88431500
H NONE
...
H NONE
$END
Последний раз редактировалось Гесс Чт ноя 14, 2019 8:37 pm, всего редактировалось 1 раз.
Причина: сокращено для удобочитаемости
Причина: сокращено для удобочитаемости
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Извините, незаметил. Но гамесс его кажется невидит.
Судя по примерам надо писать
Судя по примерам надо писать
а неO-ecp none
O none
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
нет, энтер то само собой, я про два пробела перед каждой строчкой значений орбиталей. Я не могу сейчас лично убедиться, но, насколько помню, эти пробелы и есть проблема считывания входного файла.
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Стоп, а откуда симметрия Cs?
Там C1, а ECP наверняка ждет All atoms must be given here in $ECP, not just the symmetry unique atoms.
Там C1, а ECP наверняка ждет All atoms must be given here in $ECP, not just the symmetry unique atoms.
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Tonnie Fox писал(а): ↑Чт ноя 14, 2019 8:25 pmя про два пробела перед каждой строчкой значений орбиталей. Я не могу сейчас лично убедиться, но, насколько помню, эти пробелы и есть проблема считывания входного файла.
орбитали вчитались. Невчитался именно ECPTOTAL NUMBER OF BASIS SET SHELLS = 404
NUMBER OF CARTESIAN GAUSSIAN BASIS FUNCTIONS = 1250
NUMBER OF ELECTRONS = 262
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Вот оптимизация этой структуры с использованием еср с симметрией Сs. Прошу прощения, что файлы с облока:
out: https://cloud.mail.ru/public/Fjfs/MYvpdgBPQ
out: https://cloud.mail.ru/public/Fjfs/MYvpdgBPQ
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Ну так там то структура Cs
А у вас С1
И покажите пожалуйста его инпут
А у вас С1
И покажите пожалуйста его инпут
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Кстати, а откуда нынче ECP брать для гамеса? Попробовал на basissetexchange, выбираю базис (тот же def-2TZVP), атомы, а в файле в итоге нет блока $ECP
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Странно. Брал там же.Tonnie Fox писал(а): ↑Чт ноя 14, 2019 8:59 pmКстати, а откуда нынче ECP брать для гамеса? Попробовал на basissetexchange, выбираю базис (тот же def-2TZVP), атомы, а в файле в итоге нет блока $ECP
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Вроде все норм Или вы про элементы до криптона?Tonnie Fox писал(а): ↑Чт ноя 14, 2019 8:59 pmКстати, а откуда нынче ECP брать для гамеса? Попробовал на basissetexchange, выбираю базис (тот же def-2TZVP), атомы, а в файле в итоге нет блока $ECP
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
-
- Сообщения: 168
- Зарегистрирован: Чт май 02, 2013 7:57 pm
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Спасибо, уже нашел проблему в своем MS Edge, тупенький он или не обновлялся давно ))
Проверил Ваш инпут на домашнем калькуляторе, правда гамесса у меня нет, запустил в FF и с ключом dfttyp=b3lyp. Действительно на симметрию ругается прога, при том что задано всё вроде верно. Мне не доводилось проводить расчеты в условиях гамесс/ECP/группа симметрия, теперь самому интересно, проблема ли это или есть какие то ключи решения без перехода к С1?
Проверил Ваш инпут на домашнем калькуляторе, правда гамесса у меня нет, запустил в FF и с ключом dfttyp=b3lyp. Действительно на симметрию ругается прога, при том что задано всё вроде верно. Мне не доводилось проводить расчеты в условиях гамесс/ECP/группа симметрия, теперь самому интересно, проблема ли это или есть какие то ключи решения без перехода к С1?
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Буду проверять.Tonnie Fox писал(а): ↑Чт ноя 14, 2019 9:23 pmСпасибо, уже нашел проблему в своем MS Edge, тупенький он или не обновлялся давно ))
Проверил Ваш инпут на домашнем калькуляторе, правда гамесса у меня нет, запустил в FF и с ключом dfttyp=b3lyp. Действительно на симметрию ругается прога, при том что задано всё вроде верно. Мне не доводилось проводить расчеты в условиях гамесс/ECP/группа симметрия, теперь самому интересно, проблема ли это или есть какие то ключи решения без перехода к С1?
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
Мануал говорит лишь что нужно указывать ECP для ВСЕХ атомов а не только для symmetry unique atoms.
И в облаке был аутпут с ECP и Cs. Думаю надо лишь посмотреть на его инпут.
И в облаке был аутпут с ECP и Cs. Думаю надо лишь посмотреть на его инпут.
Re: Проблема с псевдопотенциалом в Gamess
опечатка. инпут. Чтото я сегодня несконцентрирован.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 68 гостей