*.SDF или *.MOL форматы для очень больших молекул, (больше 999 атомов или связей)

[chemigor]

Добрый день,

есть очень распространенные форматы представления геометрии молекул *.SDF или *.MOL (*.SDF - обобщение *.MOL). Описание ним есть например тут: http://www.nonlinear.com/progenesis/sdf ... dance.aspx

У меня совсем глупый вопрос, подскажите, пожалуйста, кто знает, а как этот формат записывается в случае с большими молекулами, где число атомов или число связей нельзя представить трехзначным числом?

Спасибо!

[Ahha]

Не знаю, насколько это именно то, что вас интересует, но вот. SDF и MOL созданы бабелью из PDB. Правда, с ними есть проблема: их не открывает молден. Но MarvinSpace открывает прекрасно. Исходный PDB открывается и тем, и другим.

[chemigor]

Спасибо большое!!! Вы очень классно приаттачили пример правильного SDF, и я по содержимому понял, что есть старый (V20) и новый (V30) форматы, и в новом формате число атомов можно задать любое.