Программа для конформационного поиска Uniconf

[Yury Minenkov]

Добрый день, коллеги! В группе квантово-химических расчетов ФИЦ ХФ РАН[1] разработана программа для конформационного поиска и сэмплинга Uniconf.[2] Программа может быть использована для получения конформационной выборки как изолированных молекул с вращающимися связями, так и молекулярных/ионных кластеров. В частности, в серии наших недавних работ были получены конформации модельных белков,[2] комплексов переходных металлов,[3] молекулярных,(S)n,[4] и ионных, Li+(S)n,[5] кластеров где S — органические карбонаты, используемые в коммерческих Li-ионных аккумуляторах. В качестве входных данных требуются Декартовы координаты произвольной конформации системы с указанием вращающихся связей и атомных зарядов.
Uniconf представляет собой альтернативу другим решениям в области конформационного поиска и сэмплинга, таким как CREST и ABCluster, в большинстве случаев обеспечивая большее структурное и энергетическое разнообразие генерируемых ансамблей. Исполняемый файл самой программы, а также набор вспомогательных скриптов и краткое руководство пользователя доступны для скачивания: https://github.com/QuantumChemistryGroup/uniconf-bin. Примеры применения: https://github.com/QuantumChemistryGrou ... f-Contents. Препринты статей доступны по запросу здесь или от авторов статей. Будем рады комментариям, замечаниям и предложениям!
[1] https://www.chph.ras.ru/index.php/9-str ... -raschetov
[2] https://doi.org/10.1016/j.cplett.2024.141813
[3] https://doi.org/10.1021/acs.organomet.4c00246
[4] https://doi.org/10.1002/jcc.27471
[5] https://doi.org/10.1039/D4CP03487B