Chemoffice: GAUSSIAN и GAMESS

[uran238]

Кто знает, могут ли они моделировать хим реакции с разрывом химических связей? Как это сделать? У меня получалось только снижение энергии засчёт различных конформаций и отталкивания...

[Rt19]

Кто знает, можно ли из реактивов синтезировать органическое соединение, содержащее азот? Как это сделать? У меня получался только серый порошок засчет грязной посуды.

P.S. Если хочется услышать нормальный ответ, нужно задать нормальный вопрос.

[uran238]

Хм... Спрошу по другому.
Как моделировать именно РЕАКЦИИ в GAMESS?
Например нитрование фенола.

[Rt19]

А моделировать что? Если есть желание увидеть саму реакцию - то динамикой Борна-Опенгеймера - задаете начальные скорости реагирующих частиц и наблюдаете за вашей траекторией. Но зачастую исследователей интересует не набор траекторий, а вполне конкретные физико-химические параметры реакции. И тут ответ зависит от того - что интересно.

[uran238]

Я хочу увидеть именно саму реакцию. Возможно ли это сделать, не копаясь в текстовых файлах, а прямо из ChemOffice?

[slavert]

Я хочу увидеть именно саму реакцию

Ну берешь разбавленную азотную кислоту и добавляешь фенол, только она тебе не понравится, когда ты ее увидишь, там получается черная липкая вонючая масса. Уж не знаю каким софтом это можно смоделировать, наверное лучше всего чем-нибудь вроде Maya, типа рисуешь колбу с бесцветным раствором и потом она анимируется в нечто черное и липкое

[pH<7]

Я хочу увидеть именно саму реакцию

Ну берешь разбавленную азотную кислоту и добавляешь фенол, только она тебе не понравится, когда ты ее увидишь, там получается черная липкая вонючая масса. Уж не знаю каким софтом это можно смоделировать, наверное лучше всего чем-нибудь вроде Maya, типа рисуешь колбу с бесцветным раствором и потом она анимируется в нечто черное и липкое

[Rt19]

Я хочу увидеть именно саму реакцию. Возможно ли это сделать, не копаясь в текстовых файлах, а прямо из ChemOffice?

Насколько мне известно - нет.