Устойчивость Fmoc к гидрогенолизу

[Cherep]

Проблема в температуре и возможно в пептиде.

Код: Выделить всё

https://www.chimia.ch/chimia/article/download/2010_200/4122/14807

О, ну получается, что в одном колхозе переоткрыли открытое

А пролин все же вторичный амин, а вторичные амины очень быстро снимают Fmoс. Получается что-то наподобие автокаталитической реакции.

Может и так, но вот в моём случае есть карбоксильня группа -- всё-таки донор протона и мне не понятно, сколько там в равновесии свободной аминогруппы.

Да, на сколько я помню, пептидчик Карпино ведь Fmoc предложил когда-то в начале 70-х, но в контексте синтеза пептидов Fmoc/tBu методологию стали продвигать другие дяди уже спустя лет 6-7-8. Не то Карпино ещё тогда что-то знал, что Fmoc -- совсем не идеальная группа.

А как тогда быть ребятам, у которых автоматические синтезаторы и у которых растворы Fmoc-аминокислот в банках? Часто меняют, наверное, если они понимают, с каким отстоем имеют дело.

[Nickolas]

Да, на сколько я помню, пептидчик Карпино ведь Fmoc предложил когда-то в начале 70-х, но в контексте синтеза пептидов Fmoc/tBu методологию стали продвигать другие дяди уже спустя лет 6-7-8. Не то Карпино ещё тогда что-то знал, что Fmoc -- совсем не идеальная группа.

Нет ничего идеального, к сожалению. А при такой температуре и Boc иногда тоже валится..

А как тогда быть ребятам, у которых автоматические синтезаторы и у которых растворы Fmoc-аминокислот в банках? Часто меняют, наверное, если они понимают, с каким отстоем имеют дело.

Когда нам устанавливали микроволновый синтезатор, то у меня был диалог с настройщиком с фирмы. Я ему сказал, что этот осадок, который выпадает при стоянии раствора Fmoc-аминокислот в ДМФ, скорее всего свободная по альфа-аминогруппе кислота, но он мне, видимо, не поверил Однако этот процесс не быстрый. Скорее недели, чем дни. Но мы свои растворы готовим и сразу пускаем в дело, благо синтез сам длится всего несколько часов, редко - всю ночь. Я ввел правило качать ДМФ через все фильтры после синтеза, чтобы промыть все. После этого осадка мы больше не наблюдали и фильтры не меняли.

[Jokermaniak]

Когда нам устанавливали микроволновый синтезатор, то у меня был диалог с настройщиком с фирмы. Я ему сказал, что этот осадок, который выпадает при стоянии раствора Fmoc-аминокислот в ДМФ, скорее всего свободная по альфа-аминогруппе кислота, но он мне, видимо, не поверил Однако этот процесс не быстрый. Скорее недели, чем дни. Но мы свои растворы готовим и сразу пускаем в дело, благо синтез сам длится всего несколько часов, редко - всю ночь. Я ввел правило качать ДМФ через все фильтры после синтеза, чтобы промыть все. После этого осадка мы больше не наблюдали и фильтры не меняли.

Рекомендую охлаждаемый компартмент для исходников. И/или ДМФ чистить через бензоилхлорид.