Уважаемый Nord! Прочитал данную тему и вспомнил, что в столе валяется недописанный черновик как раз по этому поводу. Если у Вас есть какие-либо ссылки, поделитесь.Nord писал(а):Проблема плоский/пирамидальный азот потихоньку становится популярной
Дело вот в чем. Мои коллеги (я сам подобными системами не занимаюсь) говорят, что то, каким получится азот неожиданно сильно зависит от метода и базиса, причем в одном и том же методе в разных базисах может получаться разный ответ, а при расширении базиса он еще и альтернитует. Так, в частности происходит в методе MP2. Более того, если я правильно помню, разные функционалы тоже дают разные результаты.
О сходимости рядов теории возмущений Меллера-Плессе (MPn)
О сходимости рядов теории возмущений Меллера-Плессе (MPn)
Нет, ссылок нет. Просто как-то на лабораторном семинаре всплыла эта проблема. Кое-кто из наших сотрудников обнаружил этот эффект, ну и покопался в литературе; оказалось что такое уже у кого-то случалось.VTur писал(а):Уважаемый Nord! Прочитал данную тему и вспомнил, что в столе валяется недописанный черновик как раз по этому поводу. Если у Вас есть какие-либо ссылки, поделитесь.Nord писал(а):Проблема плоский/пирамидальный азот потихоньку становится популярной
Дело вот в чем. Мои коллеги (я сам подобными системами не занимаюсь) говорят, что то, каким получится азот неожиданно сильно зависит от метода и базиса, причем в одном и том же методе в разных базисах может получаться разный ответ, а при расширении базиса он еще и альтернитует. Так, в частности происходит в методе MP2. Более того, если я правильно помню, разные функционалы тоже дают разные результаты.
Я лично сталкивался с похожим поведением совершенно в другой задаче: симметрия равновесной геометрии молекулы бензола сильно зависела от базиса в методе MP2.
Навскидку нашел только такую работу
THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 128, 024107 2008 писал(а): Symmetry breaking in benzene and larger aromatic molecules
within generalized valence bond coupled cluster methods
The origin of symmetry breaking SB in benzene in generalized valence bond methods is
investigated within a coupled cluster formalism that correlates all valence electrons. Retention of a
limited number of pair correlation amplitudes as in the perfect- and imperfect-pairing models that
incompletely describes interpair correlations leads to symmetry breaking as the orbitals and
amplitudes are optimized. Local correlation models that are exact for one, two, and three interacting
pairs at the doubles excitation level are compared against the exact pair correlation treatment, which
correlates four interacting pairs at once in the connected double substitution operator. For simplicity,
this comparison is performed with a second-order model of electron correlation, which is reasonably
faithful to the infinite-order result. The significant SB known for the one-pair model perfect pairing
is not eliminated at the two-pair level, but is virtually eliminated at the three-pair level. Therefore,
a tractable hybrid model is proposed, which combines three-pair correlations at the second-order
level and infinite-order treatment for the strong imperfect-pairing correlations involving one and
two-pair correlations. This model greatly reduces SB in benzene and larger delocalized systems
such as naphthalene and the phenalenyl cation and anion. The resulting optimized orbitals are
localized in the space but exhibit significant delocalization in the space. This means that
correlation effects associated with different resonance structures are treated in a more balanced way
than if the orbitals localize, leading to reduced SB. © 2008 American Institute of Physics.
DOI: 10.1063/1.2817600
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Жаль.
Когда я написал черновик, то понял, что в ЖФХ писать нельзя - пол МГУ из ЖФХ топчется на этих молекулах.
А что у Вас за семинар? Я иногда бываю в Москве, в ХимФизике.
А статья была простая: в рамках квантовой химии невозможно определить строение одного радикала, а, следовательно, и все его остальные свойства.
Насчёт бензола. У меня то же самое. Не работает для бензола теория возмущений. Не выполняются её предпосылки.
Кстати, для больших молекул МР2 также не работает.
Когда я написал черновик, то понял, что в ЖФХ писать нельзя - пол МГУ из ЖФХ топчется на этих молекулах.
А что у Вас за семинар? Я иногда бываю в Москве, в ХимФизике.
А статья была простая: в рамках квантовой химии невозможно определить строение одного радикала, а, следовательно, и все его остальные свойства.
Насчёт бензола. У меня то же самое. Не работает для бензола теория возмущений. Не выполняются её предпосылки.
Кстати, для больших молекул МР2 также не работает.
Обычный лабораторный семинар, по средам в 16:45, Химфак МГУ.VTur писал(а):Жаль.
Когда я написал черновик, то понял, что в ЖФХ писать нельзя - пол МГУ из ЖФХ топчется на этих молекулах.
А что у Вас за семинар? Я иногда бываю в Москве, в ХимФизике.
А статья была простая: в рамках квантовой химии невозможно определить строение одного радикала, а, следовательно, и все его остальные свойства.
Насчёт бензола. У меня то же самое. Не работает для бензола теория возмущений. Не выполняются её предпосылки.
Кстати, для больших молекул МР2 также не работает.
Меня заинтересовало, что это за радикал и почему квантовая химия для него непригодна?
Ну, и второе утрерждение мне тоже сходу непонятно: почему MP2 неприменимо к бензолу и большим молекулам?
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Не пойму, где мой ответ? Попытаюсь ещё раз.Nord писал(а):Меня заинтересовало, что это за радикал и почему квантовая химия для него непригодна?
(Тут мне сказали, что с н-го раза наша статья, всё-таки прошла в ЖФХ)
У меня получается строгое деление - DFT, MP2, MP4 дают неплоскую геометрию. CC,CI - плоскую. Увеличение базиса ни к чему не приводит. Решили напечатать в сборнике на Урале.
В ЖФХ, не возьмут или как обычно, не менее года, если возьмут.
Теория возмущений применима к воздействиям, меньшим разности между ближайшим уровнями (например, основным и первым возбуждённым). С увеличением числа электронов, расстояния между уровнями уменьшается, а поправка (корреляционная энергия) растёт.Nord писал(а):Ну, и второе утрерждение мне тоже сходу непонятно: почему MP2 неприменимо к бензолу и большим молекулам?
Не убедительноVTur писал(а):Теория возмущений применима к воздействиям, меньшим разности между ближайшим уровнями (например, основным и первым возбуждённым). С увеличением числа электронов, расстояния между уровнями уменьшается, а поправка (корреляционная энергия) растёт.Nord писал(а):Ну, и второе утрерждение мне тоже сходу непонятно: почему MP2 неприменимо к бензолу и большим молекулам?

1. Любой кристалл, например, можно мыслить как гигантскую молекулу с колоссальным (~10^24) числом электронов. Тем не менее, есть кристаллы изоляторов -- веществ, с конечным расстоянием между основным и первым возбужденным уровнями (запрещенная зона).
2. Даже если расстояние между уровнями мало, корреляционная поправка может быть тоже мала, если числители в формулах ТВ малы. Так происходит, например, если рассчитывать корреляционную поправку для димера чего-нибудь, в котором фрагменты достаточно удалены друг от друга.
Есть у меня парочка любопытных статей, рекомендую почитать
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS VOLUME 112, NUMBER 21 1 JUNE 2000 писал(а): Is Moller–Plesset perturbation theory a convergent ab initio method?
THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 123, 064105 2005 писал(а):On the nature of the Møller-Plesset critical point
ЗЫ Если не найдете текст -- скажите, положу в обменник.
Дополнение
Вот еще одна любопытная статья
THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 124, 094111 2006 писал(а): Singularities of Møller-Plesset energy functions
Последний раз редактировалось Nord Вс фев 10, 2008 4:37 pm, всего редактировалось 1 раз.
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
+1 Важный аспект
Первая тут:
Первая тут:
Код: Выделить всё
http://vergil.chemistry.gatech.edu/pubs/abstracts/leininger_2000_mbpt-conv.html - Abstract
http://vergil.chemistry.gatech.edu/pubs/pdf/leininger_2000_mbpt-conv.pdf - PDF Full Text
Если люди не полагают, что математика проста, то только потому, что они не понимают, как на самом деле сложна жизнь (Джон фон Нейман)
Тупо стирол считаю по DFT - плоский, как камбала, попавшая под танк. То же самое по MP2 - хрен там, гнутый градусов на 8 (это между плоскостью двойной связи с её водородами, и бензольной плоскостью). Стильбен то же самое.У нас в Чешских Будейовицах был аналогичный случай.
(Могу путать за давностью лет. Могло быть наоборот. Но помойму так.)
Потом в литературе нашли. Кто-то уже напарывался.
Хм... Тоже столкнулся с похожей проблемой. Расчитывал геометрию катионов содержащих фрагмент HetN+-NH2. Эта геометрия сильно зависит от выбора метода и базиса. Точнее если брать просто ХФ - геометрия практически не меняется от базиса - но с данными X-ray не совпадает радикально. Т.е. рентген предсказывает длину связи NN - 1,35-1,40 в зависимости от соединений, а ХФ расчет - 1,45 и выше и угол между NH2 и кольцом азина - 120, что опять так сильно расходится с X-ray. Переходим к DFT. И тут начинается пляска. Расчет в одном и том же базисе для одних предсказывает одну конформацию, если поставить заместитель - то уже другую. В пределах одного соединения - при малейшем изменении бизиса конформация может меняться. И увеличение базиса не приводит к улучшениюситуации - пляска продолжается (хотя не для всех катионов). Это для b3lyp. Для MP2 ситация повторяетсяVTur писал(а):Уважаемый Nord! Прочитал данную тему и вспомнил, что в столе валяется недописанный черновик как раз по этому поводу. Если у Вас есть какие-либо ссылки, поделитесь.Nord писал(а):Проблема плоский/пирамидальный азот потихоньку становится популярной
Дело вот в чем. Мои коллеги (я сам подобными системами не занимаюсь) говорят, что то, каким получится азот неожиданно сильно зависит от метода и базиса, причем в одном и том же методе в разных базисах может получаться разный ответ, а при расширении базиса он еще и альтернитует. Так, в частности происходит в методе MP2. Более того, если я правильно помню, разные функционалы тоже дают разные результаты.

А я вот паровоз поднимал... Но не поднял.
Ничего не могу сказать про ХФ и DFT, но про MP2 скажу. MP2 плохо описывает связи N-N, O-O, O-F, N-F, и вообще молекулы (ионы) с маленькими электроотрицательными атомами. Классический пример -- молекула озона. Геометрия в MP2 более-менее, а вот частота интисимметричного колебания завышена вдвое (!). И в перечисленных статьях (в частности, в первой), четко продемонстрировано, что теория возмущения плохо применима к такого рода молекулам.
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Уважаемый Nord! Первую статью посмотрел по ссылке SSR. Она у меня есть, про остальные не знаю, так как они в моей базе статей переведены на русский (только заглавия) и отсортированы по авторам. А авторов Вы не указали. Открывать каждую в этом журнале слишком долго.
Насчет вопроса. Я имел в виду теорию Мёллера-Плессе, где поправка в числителе есть разность между гамильтонианом и фокианом, т. е. в некотором приближении корреляционная энергия. В знаменателе стоит разность энергий ближайших состояний. Для основного состояния знаменатель с ростом числа орбиталей уменьшается, а так как число электронов увеличивается - числитель растёт. Причем растет не линейно, а круче. Т.е. я считаю, что с ростом числа атомов (электронов) требуется брать всё больше и больше поправок.
Далее, т.к. теория невариационная, то есть подозрения (но определённо сказать не могу), что в одном расчете поправка будет сверху, а в другом в том же базисе и для той же геометрии будет снизу.
Теория разработана для бесконечного числа функций разложения. Мы же считаем для конечного и с опрделенной погрешностью на все виды сходимости, да ещё с отсечками на интегралы.
Я стараюсь не использовать MPn при расчетах разностей энергий, например, внутренних вращений. Гладкость функции хуже, чем при DFT.
Насчет вопроса. Я имел в виду теорию Мёллера-Плессе, где поправка в числителе есть разность между гамильтонианом и фокианом, т. е. в некотором приближении корреляционная энергия. В знаменателе стоит разность энергий ближайших состояний. Для основного состояния знаменатель с ростом числа орбиталей уменьшается, а так как число электронов увеличивается - числитель растёт. Причем растет не линейно, а круче. Т.е. я считаю, что с ростом числа атомов (электронов) требуется брать всё больше и больше поправок.
Далее, т.к. теория невариационная, то есть подозрения (но определённо сказать не могу), что в одном расчете поправка будет сверху, а в другом в том же базисе и для той же геометрии будет снизу.
Теория разработана для бесконечного числа функций разложения. Мы же считаем для конечного и с опрделенной погрешностью на все виды сходимости, да ещё с отсечками на интегралы.
Я стараюсь не использовать MPn при расчетах разностей энергий, например, внутренних вращений. Гладкость функции хуже, чем при DFT.
Ну, эти статьи представляют собой, скорее, пищу для размышлений и позволяют "прокачать интуицию" в плане того, когда MP2 можно использовать, а когда нет.VTur писал(а):Уважаемый Nord! Первую статью посмотрел по ссылке SSR. Она у меня есть, про остальные не знаю, так как они в моей базе статей переведены на русский (только заглавия) и отсортированы по авторам. А авторов Вы не указали. Открывать каждую в этом журнале слишком долго.
Насчет вопроса. Я имел в виду теорию Мёллера-Плессе, где поправка в числителе есть разность между гамильтонианом и фокианом, т. е. в некотором приближении корреляционная энергия. В знаменателе стоит разность энергий ближайших состояний. Для основного состояния знаменатель с ростом числа орбиталей уменьшается, а так как число электронов увеличивается - числитель растёт. Причем растет не линейно, а круче. Т.е. я считаю, что с ростом числа атомов (электронов) требуется брать всё больше и больше поправок.
Далее, т.к. теория невариационная, то есть подозрения (но определённо сказать не могу), что в одном расчете поправка будет сверху, а в другом в том же базисе и для той же геометрии будет снизу.
Теория разработана для бесконечного числа функций разложения. Мы же считаем для конечного и с опрделенной погрешностью на все виды сходимости, да ещё с отсечками на интегралы.
Я стараюсь не использовать MPn при расчетах разностей энергий, например, внутренних вращений. Гладкость функции хуже, чем при DFT.
Что же касается ее теоретических основ, то мне кажется, что Вы к ней несправедливы: она более обоснована, нежели все современные варианты dft.
Что же касается ее поведения при увеличении числа электронов в системе, то она ведет себя весьма регулярно, ведь для многих систем уменьшение разностей, стоящих в знаменателях, компенсируется соответствеющим изменением числителей.
Да, MP2 -- невариационный метод, хотя формально существует ее вариационная формулировка (функционал Хилераса). Но зато она размерно-согласованная, весьма дешевая и позволяет себя калибровать хотя бы по вариационныс CISD расчетам.
Обновление
Две другие статьи -- тоже в обменнике
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Большое спасибо за статьи. Согласен, что МР2 размерносогласованная (size-consistency), мне не нравится, что она size-extensivity (я перевожу, как "размерно не масштабируемая", "не линейно масштабируемая", в наших статьях я этого термина не помню), см. Jensen F., Introduction to Computational Chemistry, Chichester: John Wiley & Sons, 1999.
С добавлением всего одного электрона, корреляционная энергия возрастает на количество новых межэлектронных взаимодействий (это числитель). Даже если знаменатель не уменьшается, сама поправка растет очень круто (возможно, как и число интегралов М^5). DFT растет не так резко, поэтому это единственный способ описания молекул с 15 атомами. Для МР2 приходится снижать базис, убирать диффузные, поляризационные функции, а это переход с количественного на качественный уровень. Энергии FC и Full тоже отличаются и т.д.
Отсюда всякие фокусы с поправками, масштабированием, учетом каких-нибудь взаимодействий и прочия.
С добавлением всего одного электрона, корреляционная энергия возрастает на количество новых межэлектронных взаимодействий (это числитель). Даже если знаменатель не уменьшается, сама поправка растет очень круто (возможно, как и число интегралов М^5). DFT растет не так резко, поэтому это единственный способ описания молекул с 15 атомами. Для МР2 приходится снижать базис, убирать диффузные, поляризационные функции, а это переход с количественного на качественный уровень. Энергии FC и Full тоже отличаются и т.д.
Отсюда всякие фокусы с поправками, масштабированием, учетом каких-нибудь взаимодействий и прочия.
Ясен пень они отличаются. Зато часто FC является очень хорошим приближением. Нужно только знать, когда его включать. А не как в Гауссиане - по умолчанию включено и черт знает какие орбитали замораживает.VTur писал(а):Энергии FC и Full тоже отличаются и т.д.
А вообще, к гадалке не ходи, все DFT и MP2 - методы приблизительно одной точности 1 ккал/моль. И расширением базиса точность почти не улучшается.
Мир Вам. Не будем устраивать холивар. В реальности я уже столько перевидал не эту тему дискуссий, перепалок и чуть ли не драк, что уже знаю наверно все разумные и неразумные аргументы. И сам учавствовал, пока совсем мало опыта было.VTur писал(а):Для меня МР2 хуже.
А в этом треде меня просто улыбнули фразы про плохую применимость MP2 для больших молекул и фраза про 15 атомов.


Что касается недостатоков MP2, мне лично как-то не по себе от того, что в нем фигурируют неоптимизированные виртуальные орбитальки. Nord, что говорят на это серьезные дядьки из МГУ?
Чего-то я не понял, в чем вопросYu/2 писал(а):Что касается недостатоков MP2, мне лично как-то не по себе от того, что в нем фигурируют неоптимизированные виртуальные орбитальки. Nord, что говорят на это серьезные дядьки из МГУ?

Есть натуральные орбитали метода MP2, получаются диагонализацией одночастичной матрицы плотности, расчитанной в первом порядке. Обычно их заселенность плавно убывает по мере возрастания орбитальной энергии и, если угодно, их можно считать орбиталями, "вбирающими" эффекты корреляции на уровне MP2. С них, в принципе, можно начать, например, многоконфигурационный расчет.
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Может я чего не понимаю...Yu/2 писал(а):В формулах для расчета энергии MP2 (поправки к энергии) есть интегралы в которых есть виртуальные орбитали из ХФ, которые в этом самом ХФ не оптимизируются.Nord писал(а): Чего-то я не понял, в чем вопрос![]()
Вроде бы функционал энергии ХФ (в приближении Рутана) инвариантен относительно унитарных преобразований занятые-занятые и виртуальные-виртуальные, но неинвариантен относительно преобразования занятые-виртуальные, а в стационарном решении матричные элементы фокиана, отвечающие блоку занятые-виртуальные становятся равными нулю (теорема Бриллюэна), т.е. виртуальные и занятые орбитали связаны доп. условием и зависят друг от друга.
С другой стороны, выбор самих виртуальных орбиталей в ХФ не какой хошь, а канонический (чтобы фокиан был диагональным), поэтому все ж некоторый смысл в них есть.
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 18 гостей